เปรียบเทียบ heapsort กับ merge sort และ quicksort ของ ฮีปซอร์ต

ตัวอย่างอัลกอริทึมจัดเรียงที่เสถียร: ในการเล่นไพ่ เมื่อไพ่ถูกจัดเรียงตามอันดับด้วยการจัดเรียงที่เสถียร ไพ่เลข 5 ทั้งสองจะต้องอยู่ในลำดับเดียวกันในผลลัพธ์ที่เรียงลำดับตามเดิม แต่เมื่อเรียงด้วยการเรียงลำดับที่ไม่เสถียร ไพ่เลข 5 ทั้งสอง อาจไปอยู่ในตำแหน่งตรงข้ามกัน หลังจากที่การเรียงลำดับสิ้นสุดลง

โดยทั่วไปในทางปฏิบัติแล้ว heapsort จะช้ากว่า merge sort และ quicksort และถือเป็นอัลกอริทึมที่ไม่เสถียร (unstable algorithm) กล่าวคือ heapsort จะไม่ทำการรักษาตำแหน่งของเรคคอร์ดในอาร์เรย์ในกรณีที่ตำแหน่งสองตำแหน่งขึ้นไปนั้น มีค่า (value/key) ที่เท่ากัน[5]

อย่างไรก็ดี heapsort ไม่จำเป็นต้องใช้พื้นที่ในการเก็บข้อมูล (memory space) เหมือนกับ merge sort และเวลารันในกรณีที่แย่ที่สุดของ heapsort คือ Θ(nlogn) ทำให้เร็วกว่า quicksort ซึ่งมีเวลารันในกรณีที่แย่ที่สุดคือ O(n2)